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日本でシジミといえば、ヤマトシジミとマシジミ・セタシジミがいます。お味噌汁の具として親しまれています。他に、佃煮や時雨煮などもあります。産地としては島根県の宍道湖（しんじこ）が有名ですが、北海道や青森でも優良なシジミが獲れます。他の二枚貝に比べると小さ目のシジミですが、ヤマトシジミの中にはハマグリ並みの大きさのものもあります。